Sono organi dell'Istituto:

• il Presidente
• il Consiglio di amministrazione
• l'Organo di vigilanza

Il Presidente ha la rappresentanza legale dell'Ente.

Il Consiglio di amministrazione è l'organo di direzione politico-amministrativo, composto da cinque membri, incluso il Presidente, nominati dal Consiglio Comunale di Civitanova Marche, quattro in rappresetanza della maggioranza e uno della minoranza. Ha la stessa durata del Consiglio comunale e deve essere rinnovato entro quarantacinque giorni dalla data di insediamento di quest'ultimo, Il suo rinnovo deve avvenire anche nel caso di scioglimento anticipato dell'organo comunale. Si insedia dietro convocazione del Presidente uscente entro trenta giorni dal ricevimento delle nomine. Nella prima seduta, presieduta dal consigliere più anziano di età, elegge tra i propri membri, con votazione segreta il Presidente.

L'Organo di vigilanza è il parroco di Civitanova Marche Alta nel rispetto delle volontà della benefattrice.

Le competenze degli organi sono specificate nello Statuto.